Инфраструктура транспорта в Анадыре представлена крупным портом с внушительным грузооборотом, а также международным аэропортом. Он расположен на другой стороне лимана и связь с городом осуществляется вертолетными рейсами и ледовой переправой в зимнее время. Полеты до Москвы, Хабаровска и прочих крупных городов России и всех населенных пунктов Чукотки осуществляются регулярно.